La deuda viva de la Junta ascendió en 2009 a 9.626 millones, según indicó el consejero mayor de la Cámara de Cuentas, Antonio López, tras presentar el informe de fiscalización de ese año a la presidenta del Parlamento. Las empresas públicas registraron 107 millones en pérdidas, un 21,45% menos que en el ejercicio anterior. El ahorro bruto se cifra en 2.303 millones, un 28,6% menos que en 2008. El consejero mayor precisó que el resultado presupuestario en 2009, al igual que en 2008, sigue siendo negativo, ascendiendo a -2.549 millones frente a los -1.147 millones de euros del 2008.

El informe cifra en 1.808 millones la deuda del SAS con los proveedores. Recientemente la CEA alertó de que la Junta acumula una deuda de 946 millones a proveedores sanitarios.