Uno de los objetivos en los que concentra sus esfuerzos la Universidad Loyola es en convertirse en una Research University, una institución de alto nivel formador e investigador en el campo de las Ciencias Sociales y la Ingeniería. Actualmente Loyola está involucrada en 16 investigaciones repartidas en ámbitos internacionales, nacionales y autonómicos. En el 2015 inició su andadura la Escuela de Doctorado, que organiza e imparte los másteres en investigación y los programas de doctorado y desempeña un destacado papel en la estrategia investigadora de la universidad.