Cajasur saldó 2009 con pérdidas de 596 millones de euros y alcanzaba números negativos por 114 en el primer trimestre del 2010, que en abril podrían haber superado los 140 millones de euros. Al cierre de 2009, los recursos propios de Cajasur alcanzaban 444,3 millones de euros, frente a los 967,5 millones que exigía la ley, de modo que la ratio de solvencia se situaba en el 3,67%, por debajo del 8% debido.

Al cierre de 2009 sumaba 3.656 millones de euros en créditos concedidos al sector inmobiliario y de la construcción, el 28% del total de los 13.689 millones de euros de su cartera crediticia, según la auditoría elaborada por Deloitte sobre el ejercicio 2009 remitida a la Comisión Nacional del Mercado de Valores (CNMV). La entidad contaba además con 6.847 millones de euros concedidos a préstamos particulares, el 49% de la cartera crediticia, y 1.579 millones otorgados al sector comercial y financiero, un 11,5%. Los 78,8 millones invertidos en suelo para promociones inmobiliarias generaron 24,2 millones de pérdidas por deterioro de su activo.