El colegio Séneca ha sido premiado con el galardón Bandera Verde de la Red Europea de Ecoescuelas. Este premio supone el reconocimiento al trabajo realizado en Educación Ambiental mediante el programa de Ecoescuelas cuya finalidad es la sensibilización y educación ambiental del alumnado, familias y profesorado sobre la necesidad del respeto, cuidado y conservación del medio ambiente.

El colegio Séneca viene trabajando desde hace años en todos los niveles: trabajos en el huerto escolar, bicicletas, reciclaje, revista, talleres, etc.